BiostaTGV : outils pour la recherche clinique et les statistiques

Le site BiostaTGV, mis à disposition par l’INSERM et les université Paris VI (Pierre et Marie Curie) et Toulouse III (Paul Sabatier), permet d’accéder à de nombreux outils pour qui s’intéresse à la recherche clinique et/ou les statistiques.

Une première partie traite des études cliniques :

Une deuxième partie permet de faire en ligne les tests statistiques les plus courants, soit en entrant « Ã  la main » les valeurs, soit à partir des données d’un tableau Excel :

Zotero : mise à jour

Depuis le 28 mars, une nouvelle version de Zotero (dite béta 4, donc toujours en développement) est disponible.
Compte tenu du nombre d’améliorations et de corrections de bugs (voir le changelog sur le site de Zotero), il est plus que recommandé de mettre à jour…
Par ailleurs, le plug-in d’intégration dans word évolue lui aussi…

Enfin, de nouvelles démonstrations sont disponibles…

Rythme d’administration du Lucentis

Une publication très intéressante vient de sortir, confirmant l’intuition que certains d’entre nous commençaient à avoir quant au rythme d’administration du Lucentis.

Pour résumer la problématique : dans les études de phase III validant l’efficacité du Lucentis en traitement de la DMLA exsudative (MARINA et ANCHOR), et démontrant une amélioration de l’acuité visuelle, le rythme d’administration était d’une injection intra-oculaire mensuelle, pendant toute la durée de l’étude (1 à 2 ans).
Une troisième étude (PIER), évaluant un rythme différent (traitement d’attaque par 3 injections mensuelles puis traitement « d’entretien » par injections trimestrielles « systématiques »), a montré que si cette modalité permet d’éviter la perte de vision, elle ne permet plus d’observer une amélioration de l’acuité visuelle.
L’alternative testée ici est d’administrer le Lucentis non plus systématiquement (que ce soit tous les mois ou tous les 3 mois) après la période d’attaque de 3 injections, mais sur des critères de variation d’acuité visuelle et d’aspect OCT. Le résultat est une moyenne de 5,6 injections annuelles, et des résultats en terme d’acuité visuelle comparables aux études « pivot » !

Voilà l’abstract :

PURPOSE: To evaluate an optical coherence tomography (OCT)-guided, variable-dosing regimen with intravitreal ranibizumab for the treatment of patients with neovascular age-related macular degeneration (AMD).
DESIGN: Open-label, prospective, single-center, nonrandomized, investigator-sponsored clinical study.
METHODS: In this two-year study, neovascular AMD patients with subfoveal choroidal neovascularization (CNV) (n = 40) and a central retinal thickness of at least 300 mum as measured by OCT were enrolled to receive three consecutive monthly intravitreal injections of ranibizumab (0.5 mg). Thereafter, retreatment with ranibizumab was performed if one of the following changes was observed between visits: a loss of five letters in conjunction with fluid in the macula as detected by OCT, an increase in OCT central retinal thickness of at least 100 mum, new-onset classic CNV, new macular hemorrhage, or persistent macular fluid detected by OCT at least one month after the previous injection of ranibizumab.
RESULTS: At month 12, the mean visual acuity improved by 9.3 letters (P < .001) and the mean OCT central retinal thickness decreased by 178 mum (P < .001). Visual acuity improved 15 or more letters in 35% of patients. These visual acuity and OCT outcomes were achieved with an average of 5.6 injections over 12 months. After a fluid-free macula was achieved, the mean injection-free interval was 4.5 months before another reinjection was necessary.
CONCLUSION: This OCT-guided, variable-dosing regimen with ranibizumab resulted in visual acuity outcomes similar to the Phase III clinical studies, but required fewer intravitreal injections. OCT appears useful for determining when retreatment with ranibizumab is necessary.

Référence : Am J Ophthalmol. 2007 Apr;143(4):566-583. An Optical Coherence Tomography-Guided, Variable Dosing Regimen with Intravitreal Ranibizumab (Lucentis) for Neovascular Age-related Macular Degeneration. Fung AE, Lalwani GA, Rosenfeld PJ, Dubovy SR, Michels S, Feuer WJ, Puliafito CA, Davis JL, Flynn HW Jr, Esquiabro M.

Bibliographie en ligne : Connotea

L’une des limites avec les logiciels de bibliographie est le fait que l’enregistrement se fait sur disque dur (EndNote ou Zotero par exemple). Or, certains d’entre nous travaillent sur plusieurs ordinateurs (bureau et portable par exemple) et/ou en plusieurs lieux (travail, domicile, bibliothèque, hôtel…) : il peut pourtant être important de pouvoir accéder à tout moment et de partout à ses références bibliographiques…
Des solutions existent déjà pour les « favoris » ou « marque-page » internet, avec un outil comme del.icio.us… Et bien, le même système existe pour enregistrer des références bibliographiques en ligne : Connotea (créé par Nature).

Connotea

Gratuit, après une inscription simple, Connotea permet, d’un simple clic sur un bouton à rajouter à son navigateur, d’enregistrer, directement à partir de Pubmed par exemple (mais pas seulement) une référence dans sa bibliographie en ligne, et d’accéder donc à sa base de donnée bibliographique de n’importe quel ordinateur connecté à internet.
Il est bien sur possible d’ajouter à chaque référence des commentaires et des mots-clés.

Une autre fonctionnalité intéressante est la possibilité de partager sa biographie, avec des collègues travaillant sur le même sujet par exemple (mais il reste possible de garder ses références « privées »).

Un film de démonstration est disponible sur le site…

Limite du système, il n’existe pas pour le moment d’intégration avec les logiciels de traitement de texte. Il est cependant possible d’exporter ses références sous un format reconnu par les principaux gestionnaires de bibliographie « logiciels »…

Finalement, la conclusion rejoindra celle du premier billet concernant Zotero : le jour où les deux seront liés, et l’intégration de Zotero aux traitements de texte finalisée, nous aurons à notre disposition un outil de bibliographie GRATUIT sans concurrence !

Ressources utiles sur internet et/ou l'ophtalmologie… et un peu plus encore.